Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NME2P1O60361 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NME2P1O60361 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms