Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAB2O43741 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms