Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTATSF1O43719 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTATSF1O43719 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms