Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLOCKO15516 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLOCKO15516 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms