Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
POLR3AO14802 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
POLR3AO14802 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms