Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EBAG9O00559 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms