Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PIK3C2AO00443 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIK3C2AO00443 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms