Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DCTN6O00399 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms