Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PMD0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PMD0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PMD0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PMD0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PMD0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PMD0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms