Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms