Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HMX3A6NHT5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms