Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms