Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS37CA5D8V6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms