Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAMB4A4D0S4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMB4A4D0S4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms