Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEF22A3QJZ6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms