Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC144AA2RUR9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC144AA2RUR9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms