Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ9

TRAV30, T-cell receptor alpha variable 30 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30A0A087WSZ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRAV30A0A087WSZ9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAV30A0A087WSZ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms