Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RUNX1T1-248ENST00000613302 7687 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCB4-202ENST00000358400 3826 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FMN2-206ENST00000543681 2902 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC23IP-201ENST00000369075 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EYA3-203ENST00000373871 6085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRP1-212ENST00000432372 4137 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF827-203ENST00000508784 7463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERPINB8-203ENST00000397985 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA31C2-201ENST00000324915 3777 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512624.2-201ENST00000621705 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL079307.1-201ENST00000553312 5982 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 THADA-202ENST00000402360 2974 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRKH-201ENST00000368822 3093 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM2-203ENST00000437508 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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