Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEDD8Q15843 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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