Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TCIRG1Q13488 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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