Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC113383.1-205ENST00000502253 792 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CSAG4-202ENST00000583763 237 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC010761.6-201ENST00000587898 197 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC006159.1-201ENST00000452009 386 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RN7SL236P-201ENST00000484759 284 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PTCSC3-201ENST00000556013 571 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL358334.1-201ENST00000557152 174 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IGHV3OR16-15-201ENST00000565463 414 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RN7SL155P-201ENST00000581538 263 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
ANKRD39Q53RE8 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms