Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
NEDD9Q14511 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms