Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 LAMA3-207ENST00000587184 5007 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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HOXD11P31277 LIMA1-216ENST00000552909 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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HOXD11P31277 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
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HOXD11P31277 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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HOXD11P31277 RN7SL154P-201ENST00000578043 324 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
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HOXD11P31277 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 NLGN4X-201ENST00000275857 5454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 TBC1D8B-206ENST00000481617 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
HOXD11P31277 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
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