Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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COL9A2Q14055 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL9A2Q14055 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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COL9A2Q14055 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
COL9A2Q14055 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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