Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CLN3Q13286 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CLN3Q13286 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms