Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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ZNF548Q8NEK5 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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ZNF548Q8NEK5 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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ZNF548Q8NEK5 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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ZNF548Q8NEK5 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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ZNF548Q8NEK5 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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ZNF548Q8NEK5 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ZNF548Q8NEK5 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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