| RUNX2 | Q13950 | RPL21P65-201 | ENST00000406094 | 466 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU2-47P-201 | ENST00000410649 | 186 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-6P-201 | ENST00000410804 | 122 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC019064.1-201 | ENST00000414796 | 499 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPS7P15-201 | ENST00000415804 | 584 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004552.1-201 | ENST00000419089 | 348 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NAALADL2-AS1-201 | ENST00000426315 | 804 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138775.1-201 | ENST00000429539 | 575 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ARHGEF7-AS1-201 | ENST00000435037 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC092641.1-201 | ENST00000440229 | 772 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC006458.1-201 | ENST00000445093 | 653 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NPM1P49-201 | ENST00000448027 | 714 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590365.1-201 | ENST00000450788 | 243 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GAS5-223 | ENST00000452197 | 483 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Z82190.1-201 | ENST00000454534 | 490 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAJC19P1-201 | ENST00000455312 | 319 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TPT1P7-201 | ENST00000458300 | 517 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RPS26P3-201 | ENST00000470205 | 348 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RPL31P13-201 | ENST00000484151 | 370 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC004057.1-201 | ENST00000485827 | 348 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBE2Q2P9-201 | ENST00000490086 | 202 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AC008572.1-201 | ENST00000507269 | 442 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP154-201 | ENST00000516193 | 111 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC079209.2-201 | ENST00000519107 | 431 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MTCYBP41-201 | ENST00000528913 | 1123 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL354920.1-202 | ENST00000531661 | 1017 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP002370.2-203 | ENST00000533101 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC136188.1-201 | ENST00000546770 | 342 nt | TSL 3 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL355073.1-201 | ENST00000560296 | 517 nt | TSL 4 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02562-201 | ENST00000561705 | 785 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC007224.1-201 | ENST00000564410 | 144 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL139395.1-201 | ENST00000603662 | 160 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097717.1-249 | ENST00000608040 | 401 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HULC.1-201 | ENST00000612720 | 240 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZYXP1-201 | ENST00000617638 | 118 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL596220.1-201 | ENST00000622121 | 542 nt | TSL 4 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | UBA6-201 | ENST00000322244 | 9564 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF962P-201 | ENST00000443465 | 3140 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL645937.1-201 | ENST00000641739 | 1652 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DDX60L-209 | ENST00000511577 | 6781 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL391684.1-201 | ENST00000416191 | 2998 nt | TSL 5 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | DNAH12-201 | ENST00000311202 | 1555 nt | TSL 2 BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TEX21P-201 | ENST00000447107 | 1476 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ZNF616-201 | ENST00000330123 | 2563 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MFF-206 | ENST00000392059 | 1710 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XRN1-202 | ENST00000392981 | 5383 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NCOA1-203 | ENST00000395856 | 6828 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.46-201 | ENST00000362695 | 102 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLRC3-201 | ENST00000381903 | 798 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | OR5H15-201 | ENST00000383696 | 930 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR93-201 | ENST00000385024 | 80 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD115.1-201 | ENST00000391109 | 76 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL7P25-201 | ENST00000404151 | 721 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.608-201 | ENST00000410647 | 95 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-248P-201 | ENST00000410720 | 107 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC078974.1-201 | ENST00000411597 | 223 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | AP001136.1-201 | ENST00000425058 | 635 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093581.1-202 | ENST00000430890 | 391 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL138759.1-201 | ENST00000432120 | 645 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL080313.1-201 | ENST00000434947 | 405 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL117336.1-201 | ENST00000439198 | 380 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PGBD4P3-201 | ENST00000440731 | 581 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC135371.1-201 | ENST00000446964 | 453 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
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| RUNX2 | Q13950 | SSXP1-201 | ENST00000453640 | 473 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC021382.1-201 | ENST00000483523 | 359 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SL271P-201 | ENST00000487601 | 295 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | KLHL6-AS1-201 | ENST00000491676 | 503 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC097521.1-201 | ENST00000505488 | 567 nt | TSL 3 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC108210.1-201 | ENST00000510772 | 825 nt | TSL 3 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | GYPA-208 | ENST00000512064 | 441 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC00491-204 | ENST00000513815 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PAICSP4-201 | ENST00000517543 | 1253 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC140847.1-201 | ENST00000538025 | 534 nt | TSL 4 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RFPL1S-203 | ENST00000539579 | 330 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MRPL42-204 | ENST00000548545 | 692 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02286-201 | ENST00000552425 | 285 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC107023.1-201 | ENST00000552757 | 356 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL162311.1-201 | ENST00000553046 | 601 nt | TSL 3 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MSMB-201 | ENST00000581478 | 386 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | LINC02079-201 | ENST00000582518 | 294 nt | TSL 2 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC005771.1-201 | ENST00000585581 | 349 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTN-AS1-228 | ENST00000589234 | 751 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | XIAPP1-201 | ENST00000603162 | 600 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC008638.3-201 | ENST00000603341 | 463 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC112191.3-201 | ENST00000604371 | 277 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNF219-AS1-205 | ENST00000605996 | 792 nt | TSL 5 BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000254.1-201 | ENST00000609934 | 520 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ANKRD36C-207 | ENST00000612359 | 650 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL590099.1-201 | ENST00000615276 | 138 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC002550.2-201 | ENST00000621246 | 394 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC012150.2-201 | ENST00000621300 | 544 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| RUNX2 | Q13950 | C2orf27A-204 | ENST00000623058 | 969 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |