Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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