Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RGS7-202ENST00000366563 2206 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL049647.1-201ENST00000319682 1789 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SWT1-202ENST00000367501 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL591896.1-201ENST00000420211 491 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LINC00570-203ENST00000437795 490 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MBP-206ENST00000397863 4800 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RNPC3-208ENST00000533099 3641 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 KLHL2-209ENST00000514860 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 SYCP1-202ENST00000369522 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 WDR78-203ENST00000371026 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
HOXD11P31277 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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