Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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USP18Q9UMW8 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
USP18Q9UMW8 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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