Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LAPTM4AQ15012 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LAPTM4AQ15012 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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