Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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KCNMA1Q12791 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KCNMA1Q12791 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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