Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.99-201ENST00000621370 254 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL688P-201ENST00000471754 275 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC02403-201ENST00000548215 484 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC090699.1-201ENST00000586264 321 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LRP12-201ENST00000276654 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD39Q53RE8 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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