Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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COL9A2Q14055 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL9A2Q14055 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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