Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PGGT1BP53609 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
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PGGT1BP53609 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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