Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 ABCC4-201ENST00000376887 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 OR7E25P-202ENST00000641088 5937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 TBX22-202ENST00000373296 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 CDH18-203ENST00000502796 2386 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 FHL1-201ENST00000345434 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SLC7A2-203ENST00000470360 7638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 ATP1A4-201ENST00000368081 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MAPK10-228ENST00000512689 2583 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SENP3Q9H4L4 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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