Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
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PKD2Q13563 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
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PKD2Q13563 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
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PKD2Q13563 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
PKD2Q13563 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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