Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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GRIK2Q13002 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
GRIK2Q13002 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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