Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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NFIAQ12857 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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