Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
SHOC2Q9UQ13 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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