Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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NKX1-1Q15270 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NKX1-1Q15270 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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