Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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