Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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SGCGQ13326 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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