Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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KCNMA1Q12791 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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