Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETBP1Q9Y6X0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETBP1Q9Y6X0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms