Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
USH1CQ9Y6N9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
USH1CQ9Y6N9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms