Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
NRXN3Q9Y4C0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NRXN3Q9Y4C0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms