Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
DCAF1Q9Y4B6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
DCAF1Q9Y4B6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms