Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNEQ9Y223 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms