Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGTPBP1Q9UPW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGTPBP1Q9UPW5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms